Học viện Quản lý Giáo dục được thành lập năm 2006, tiền thân là Trường Cán bộ quản lý giáo dục ra đời năm 1976. Trong những năm qua, Học viện luôn làm tốt sứ mệnh đào tạo đại học và sau đại học, bồi dưỡng theo ngạch và theo chức danh công chức, viên chức ngành giáo dục; nghiên cứu, phát triển và ứng dụng khoa học quản lý giáo dục, góp phần vào sự nghiệp phát triển giáo dục và đào tạo của nước nhà trong thời kỳ hội nhập kinh tế quốc tế.
Hơn 3 thập niên hoạt động và phát triển với những đóng góp quan trọng vào sự nghiệp phát triển giáo dục đào tạo nước nhà, từ Trường Cán bộ quản lý giáo dục và đào tạo ngày nào cho tới Học viện Quản lý Giáo dục của ngày hôm nay đã được Nhà nước tặng nhiều phần thưởng cao quý:
- Chủ tịch nước tặng Huân chương Lao động hạng Ba năm 1986, hạng Nhì năm 1996, hạng Nhất năm 2011;
- Thủ tướng Chính phủ tặng Bằng khen năm 2006, Cờ thi đua năm học 2009 - 2010, Bằng khen vì có thành tích xuất sắc trong công tác đào tạo nguồn nhân lực phục vụ cho công tác Hội nhập quốc tế giai đoạn 2003 - 2010;
- Bộ GD&ĐT công nhận là Đơn vị lao động tiên tiến xuất sắc năm học 2007 - 2008, tặng Bằng khen năm học 2008 - 2009, Cờ thi đua năm học 2009 - 2010.